Параметры просмотра файлов и папок в Nautilus

You can change how files and folders are grouped and sorted by default. Press the menu button in the top-right corner of the window, select Preferences, and then select the Views tab.

Вид по умолчанию

Выстраивать элементы: You can change how files are sorted in an individual folder by clicking the view options menu button in the toolbar and choosing the desired option under Sort, or by clicking the list column headers in list view.
Помещать папки перед файлами: По умолчанию, менеджер файлов теперь не придерживается порядка сортировки «сначала папки, потом файлы». Включите этот параметр, чтобы папки шли перед файлами.